Впервые музей бабочек открылся в 2007 г. В период с 2013 по 2016 гг. проводилась реконструкция ВДНХ. После ее окончания дом бабочек снова начал принимать посетителей. В обновленном музее произошли изменения. Организаторы открыли еще один зал. Вступили в силу новые правила.